剑星共有三个不同结局，分别是返回拓殖区、创造新的往事、记忆失落的代价。玩家需通过与艾德姆的不同选择及达成特定条件来解锁，具体如下：

一、返回拓殖区：在最终与艾德姆对话时拒绝其建议，建议提前将存档上传至PS+云服务。触发该结局后伊芙带领人类回到拓殖区，但地球仍被孽奇拔控制。

二、创造新的往事：接受艾德姆的提议，并确保莉莉头像的进度条达到100%（需收集特定物品并完成相关任务）。随后前往埃尔多斯9号，结局为伊芙留在地球上参与文明重建。

三、记忆失落的代价：拒绝艾德姆的提议，同时未完成与莉莉相关的全部百合进度条（即未收集足够的记忆棒和文档），也无需前往埃尔多斯9号。结局为伊芙独自踏上旅程，部分记忆遗失。